Aplicaţiile terapeutice ale ultrasunetelor sunt: în inflamări şi îmbolnăviri degenerative ale oaselor şi muşchilor (artrite, artroze, entorse etc.), tratament al sistemului nervos (nevralgii, herpes ş.a.), inflamări ale pielii (ulcus, panariţiu etc.), în psihiatrie (prin încălziri profunde în creier), în neurochirurgie, pentru producere de leziuni (de exemplu în cazul tratamentului bolii Parkinson), distrugere de calculi renali şi din vezica urinară, producere de aerosoli, în stomatologie (şlefuiri, detartrări rapide).
Fizioterepia cu ultrasunete se bazează pe acţiunea fiziologică a acestora, care constă în efecte mecanice, termice, fizice. Datorită acestor efecte, ţesuturile sunt stimulate mechanic sub forma de “micromasaj” şi se încălzesc, suferind reacţii chimice favorabile organismului.